زمانی ژاوی در لیست فروش باشگاه قرار داشت، تصمیم به ماندن گرفت، و سپس به رقابت های یورو 2008 اتریش و سوئیس رفته و با قهرمانی بازگشت.
او در مصاحبه با AS به یادآوری تمام این خاطرات می پردازد:
باشگاه پیشنهادات برای من را می پذیرفت!!!
ما دو سال بدون فتح عنوان سپری کرده بودیم و چنین اتفاقاتی رخ می داد.
من به مدت 10 دقیقه با پپ دیدار کردم و دیدم که او مشخصاً در بارسلونا موفق خواهد شد. او نقطه مرجع فوتبالی من بود و حالا مربی ام می شد.
البته سال ها قبل من در آستانه انتقال به میلان بودم، اما مادرم گفت نه.
لوییس فانخال در 6 فوریه 1999، ژاوی هرناندس 19ساله را به تیم بارسلونا ب برگرداند.
پپ گواردیولا تازه از مصدومیت برگشته بود و مربی هلندی میخواست که ژاوی در میدان حضور پیدا کند، فرصتی که در تیم اصلی بارسلونا برای او مهیا نبود.
ژاوی در فصل 99-1998 به ترکیب اصلی تیم رسید و 14 بازی هم انجام داد، و حتی یک گل هم مقابل وایادولید با ضربه سر زد.
ژاوی در آن هنگام گفت: «فانخال به من گفت که جایی در تیم اصلی ندارم. رفتن به تیم ب بهتر از نشستن روی نیمکت یا سکوها است. من از بازی در بارسلونا ب نمیترسم. اگر اینطور است، مشکلی نیست.»
در آن هنگام آدریانو گالیانی و میلان میخواستند این بازیکن اسپانیایی را به خدمت بگیرند و به او یک ویلا، 250 میلیون پزو، قراردادی پنجساله، یک کار برای پدرش، و وعده بازی در تیم اصلی را پیشنهاد دادند. پدر او با انتقالش موافق بود، اما مادرش حتی حاضر نبود این را بررسی کند.
ژاوی یک بار گفت: «اگر کسی بیشتر از من طرفدار بارسلونا باشد، او مادرم است». مادر او هم گفت: «به نظرم او باید میماند. به همین دلیل بود که همسرم را تهدید کردم که اگر پسرم به میلان برود، از او جدا خواهم شد!»